中小企業稅收籌劃的操作方式有：

一、合理選擇企業組織形式

公司在設立分支機構時，選擇設立子公司還是分公司會對企業所得稅負產生影響。子公司是獨立法人，應當作為獨立的納稅義務人單獨交納企業所得稅。如果子公司盈利，母公司虧損，其利潤不能并入母公司。分公司不是獨立法人，其利潤并入母公司匯總繳納企業所得稅，具有盈虧相抵的作用，能降低總公司整體的稅負。因此，公司在設立分支機構時，要做好所得稅的納稅籌劃，合理選擇企業組織形式。創業初期，有限的收入不足抵減大量支出的企業一般應設為分公司，而能夠迅速實現盈利的企業一般應設為法人，另外，具有法人資格的子公司，在符合“小型微利企業”的條件下，還可以減按20%的稅率繳納企業所得稅。

二、及時合理列支費用

及時合理列支費用支出主要表現在費用的列支標準、列支期間、列支數額、扣除限額等方面，具體來講，進行費用列支時應注意以下幾點：

1、發生商品購銷行為要取得符合要求的發票。

2、費用支出要取得符合規定的發票。

3、費用發生及時入賬，稅法規定納稅人某一納稅年度應申報的可扣除費用不得提前或滯后申報扣除，所以在費用發生時要及時入賬。

4、適當縮短攤銷期限，以后年度需要分攤列支的費用、損失的攤銷期要適當縮短，例如長期待攤費用等的攤銷應在稅法允許范圍內選擇最短年限，增大前幾年的費用扣除，遞延納稅時間。

三、合理選擇存貨計價方法

各項存貨的發出和領用，其實際成本的計算方法有先進先出法、加權平均法和個別計價法等。

加權平均法：對企業發出和領用存貨進行計價，企業計入各期產品成本的材料等存貨的價格比較均衡，不會忽高忽低，特別是在材料等存貨價格差別較大時，可以起到緩沖的作用，使企業產品成本不致發生較大變化，各期利潤比較均衡。

先進先出法：在物價持續下降的情況下，對企業存貨進行計價，才能提高企業本期的銷貨成本，相對減少企業當期收益，減輕企業的所得稅負擔。

1、收集稅收籌劃必須的信息。在收集信息的時候，主要包括：企業涉稅情況與需求分析、企業相關稅收政策與環境分析、確定稅收籌劃的具體目標。需要注意的是：在收集信息的時候，如果能夠確保信息的全面性，那么對于企業稅收籌劃的成功也會有所幫助。
2、設計備選的稅收籌劃方案。 在掌握相關信息和確立目標之后，稅收籌劃的決策者可以著手設計稅收籌劃的具體方案。稅收籌劃方案的設計一般按以下步驟進行：首先，對涉稅問題進行認定，即涉稅項目的性質，涉及哪些稅種等；其次，對涉稅問題進行分析，即涉稅項目的發展態勢，引發后果，稅收籌劃空間大小，需解決的關鍵問題等；最后，設計多種備選方案，即針對涉稅問題，設計若干可選方案，包括涉及的經營活動、財務運作和會計處理確定配套方案。
3、分析、評價各個備選方案，并選擇一個最佳方案。稅收籌劃方案是多種籌劃技術的組合運用，同時需要考慮風險因素。方案列示以后，必須進行一系列的分析，主要包括：合法性分析、可行性分析以及目標分析。
4、實施該稅收籌劃方案。稅收籌劃方案選定之后，經管理部門批準，即進入實施階段。企業應當按照選定的稅收籌劃方案，對自己的納稅人身份、組織形式、注冊地點、所從事的產業、經濟活動以及會計處理等做出相應的處理或改變，同時記錄籌劃方案的收益。
5、對該稅收籌劃方案進行監控、評估和改進。在稅收籌劃方案的實施過程中，應及時監控出現的問題。再運用信息反饋制度，對籌劃方案的效果進行評價，考核其經濟效益與最終結果是否實現稅收籌劃目標。在實施過程中，可能因為執行偏差、環境改變或者由于原有方案的設計存在缺陷，從而與預期結果產生差異，這些差異要及時反饋給稅收籌劃的決策者，并對方案進行改進。