研發(fā)費用比例一直是高新技術企業(yè)認定的核心，也是評審和稅務部門審核的關鍵，每年進行研發(fā)費用加計扣除申報工作，就是提前讓稅務部門認可研發(fā)費用總額。稅務機構在對高新企業(yè)研發(fā)費用發(fā)生情況進行認定前，還會去企業(yè)實地調(diào)查，企業(yè)在調(diào)查過程中應該與稅務機關積極溝通，按照稅務機關的要求規(guī)范研發(fā)費用的管理。

企業(yè)要注意稅務申報系統(tǒng)中所得稅匯算清繳數(shù)據(jù)與企業(yè)年度審計報告的一致性。因各種原因，企業(yè)的匯算清繳數(shù)據(jù)與年度審計報告和賬面數(shù)據(jù)可能不一致，特別是涉及到主營業(yè)務收入、主營業(yè)務成本、管理費用、利潤總額等關鍵數(shù)據(jù)，將來報送材料時可能會被要求出具很多說明，甚至會被認為申報材料不真實，這就要求企業(yè)在日常財務工作中應該注意這些關鍵數(shù)據(jù)的準確性和一致性，加強人員的培訓和管理，以免出現(xiàn)類似的差錯。